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| ★蛋白质的相关分析 |
| l 蛋白质的氨基酸组成分析，各氨基酸所占比例分析（重量比、摩尔数比）；疏水、亲水、中性氨基酸的比例分析； |
| l 蛋白质的反翻译分析（retro-translation）、 |
| l 等电点分析；在不同缓冲液中的带电分析 |
| l 信号肽分析 |
| l 跨膜区分析 |
| l 亲疏水分析、区段亲疏水分析 |
| l 抗原相关分析见《基因工程》部分 |
| l 抗原表位的预测分析（B细胞、T细胞表位预测分析） |
| l 二级结构分析预测 |
| l 蛋白酶切割位点分析 |
| l 蛋白质的翻译后加工分析：如乙酰化、糖基化、磷酸化、等等。 |
| l 抗原区段寻找预测、蛋白表面寻找预测 |
| l 基因工程蛋白稳定性分析。 |
| l 蛋白质的定位预测与分析 |
| l 三级、四级结构预测与分析 |
| l 蛋白质的点突变分析 |
| l 蛋白质工程设计与分析：包括蛋白质的点突变分析 |
| l 蛋白质的抗原性分析：如分析整体蛋白的免疫原性强弱、是否适合做基因工程抗原；分段分析免疫原性强弱等。 |
